Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC15Q9P013 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC15Q9P013 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC15Q9P013 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC15Q9P013 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC15Q9P013 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC15Q9P013 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC15Q9P013 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC15Q9P013 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC15Q9P013 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms