Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD4Q9NZQ9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD4Q9NZQ9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD4Q9NZQ9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD4Q9NZQ9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD4Q9NZQ9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD4Q9NZQ9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD4Q9NZQ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD4Q9NZQ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD4Q9NZQ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD4Q9NZQ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD4Q9NZQ9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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TMOD4Q9NZQ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMOD4Q9NZQ9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
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TMOD4Q9NZQ9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD4Q9NZQ9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
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