Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ARHGEF12Q9NZN5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARHGEF12Q9NZN5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
ARHGEF12Q9NZN5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARHGEF12Q9NZN5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms