Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKIRAS2Q9NYR9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKIRAS2Q9NYR9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKIRAS2Q9NYR9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKIRAS2Q9NYR9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKIRAS2Q9NYR9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKIRAS2Q9NYR9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKIRAS2Q9NYR9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKIRAS2Q9NYR9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKIRAS2Q9NYR9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKIRAS2Q9NYR9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKIRAS2Q9NYR9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKIRAS2Q9NYR9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKIRAS2Q9NYR9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NKIRAS2Q9NYR9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKIRAS2Q9NYR9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms