Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXC10Q9NYD6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXC10Q9NYD6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms