Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VNN3Q9NY84 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VNN3Q9NY84 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms