Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM260Q9NX78 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM260Q9NX78 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms