Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM248Q9NWD8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM248Q9NWD8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms