Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLIMQ9NVW2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms