Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCF3Q9NUQ8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms