Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TM7SF3Q9NS93 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms