Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP3Q9NS15 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP3Q9NS15 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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