Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42SE2Q9NRR3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42SE2Q9NRR3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms