Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
DUOX2Q9NRD8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
DUOX2Q9NRD8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms