Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA8

EIF4ENIF1, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4ENIF1Q9NRA8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF4ENIF1Q9NRA8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4ENIF1Q9NRA8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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