Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSCN3Q9NQT6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FSCN3Q9NQT6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms