Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRIP3Q9NQ35 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRIP3Q9NQ35 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms