Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SSU72Q9NP77 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSU72Q9NP77 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms