Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC56

PCDH9, Protocadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH9Q9HC56 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH9Q9HC56 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH9Q9HC56 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms