Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP29Q9HBJ7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP29Q9HBJ7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms