Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER2Q9H7U1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms