Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms