Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCAS3Q9H6U6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAS3Q9H6U6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms