Protein–RNA interactions for Protein: Q9H426

RIMS4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS4Q9H426 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS4Q9H426 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms