Protein–RNA interactions for Protein: Q9H322

VCX2, Variable charge X-linked protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX2Q9H322 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VCX2Q9H322 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms