Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X0

CHRD, Chordin, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDQ9H2X0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRDQ9H2X0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms