Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNMDQ9H2S6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNMDQ9H2S6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms