Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB17Q9H0T7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms