Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP44Q9C0F1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP44Q9C0F1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms