Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
INO80BQ9C086 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms