Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CELF4Q9BZC1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms