Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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KRTAP9-3Q9BYQ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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