Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NIFKQ9BYG3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms