Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC8Q9BY41 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms