Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PACSIN1Q9BY11 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PACSIN1Q9BY11 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms