Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms