Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL25A1Q9BXS0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms