Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BRIP1Q9BX63 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRIP1Q9BX63 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRIP1Q9BX63 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms