Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM43Q9BTV4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms