Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP2Q9BSJ2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms