Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZSWIM1Q9BR11 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms