Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE5

APOL2, Apolipoprotein L2, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL2Q9BQE5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL2Q9BQE5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms