Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMCHL2Q9BQD1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms