Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA3Q99618 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA3Q99618 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA3Q99618 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms