Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC1Q99614 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms