Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF4Q99607 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms