Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms