Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF13CQ96RJ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF13CQ96RJ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF13CQ96RJ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF13CQ96RJ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF13CQ96RJ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms