Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3IPQ96QF0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms