Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TEFMQ96QE5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms